LISTE DES ABREVIATIONS

 

 

A2058

Adénine 2058 de l’ARNr 23S (numérotation E. coli)

A660

Absorbance à 660 nm

aa

Acide aminé

ABC

ATP-binding cassette

AcOEt

Acétate d’éthyle

ACR

Acriflavine

ADN

Acide désoxyribonucléique

AMP-PNP

Adénosine 5’(b-g-imido) triphosphate

ARNm

Acide ribonucléique messager

ARNr

Acide ribonucléique ribosomal

ATCC

American Type Culture Collection

ATP

Adénosine triphosphate

Ca

Carbone a

CA-SFM

Comité de l’Antibiogramme de la Société Française de Microbiologie

CCCP

Chlorophénylhydrazone du mésoxazolonitrile

CERMN

Centre d’Etudes et de Recherche du Médicament de Normandie

CHCl3

Chloroforme

CIP

Ciprofloxacine

CMI

Concentration minimale inhibitrice

CNRS

Centre National de la Recherche Scientifique

Composé B

4-phényl-2,6-diméthyle-3,5-pyridinedicarboxylate de diéthyle

Cpm

Coups par minute

DAPI

4’,6-diamidino-2-phénylindole

DMSO

Diméthylsulfoxyde

EDTA

Acide éthylène diamine tétra acétique

ENSCP

Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris

ERY

Erythromycine

EtBr

Bromure d’éthidium

EtOH

Ethanol

G03

Benzothiophène 622-04-01-L-G03

D06

Molécule 126-01-02-L-D06

Hex

Hexane

IPE

Inhibiteur de Pompe d’Efflux

kb

Kilo bases

LB

Luria Bertani

MATE

Multidrug and toxic compound extrusion

MDR

Multi-drug resistance

MeOH

Méthanol

MFP

Membrane fusion protein (protéine de fusion membranaire)

MFS

Major Facilitator Superfamily

MH

Mueller Hinton

MLS

Macrolides, lincosamides et streptogramines

NBD

Domaine de liaison des nucléotides (Nucleotide Binding Domain)

nm

nanomètres

NOR

Norfloxacine

OMF

Outer Membrane Factor

PAbN

L-Phe-L-Arg-b-naphthylamide

pb

Paire de bases

PBS

Phosphate buffer saline

PCR

Polymerase chain reaction

PDB

Protein Data Bank

PEF

Pefloxacine

P-gp

Glycoprotéine P

QRDR

Quinolone Resistance Determining Region

RES

Réserpine

RMN

Résonance Magnétique Nucléaire

RND

Resistance nodulation and cell division

SA

Streptogramine A

SARM

S. aureus résistant à la méthicilline

SB

Streptogramine B

SDR

Specific drug resistance

SDS

Sel de sodium de l’acide dodécyl sulfonique

SMR

Small multidrug resistance

TEMED

N, N, N’, N’-Tétraméthyléthylène diamine

TMS

Segment transmembranaire

TPP+

Bromure de tétraphénylphosphonium

U.A.

Unités Arbitraires

UFC

Unités Formant Colonie

UV

Ultra Violet

 

ABREVIATIONS DES ACIDES AMINES

 

 

Acide aminé

Abréviation à 3 lettres

Abréviation à 1 lettre

Alanine

Ala

A

Arginine

Arg

R

Asparagine

Asn

N

Acide aspartique

Asp

D

Cystéine

Cys

C

Acide glutamique

Glu

E

Glutamine

Gln

Q

Glycine

Gly

G

Histidine

His

H

Isoleucine

Ile

I

Leucine

Leu

L

Lysine

Lys

K

Méthionine

Met

M

Phénylalanine

Phe

F

Proline

Pro

P

Sérine

Ser

S

Thréonine

Thr

T

Tryptophane

Trp

W

Tyrosine

Tyr

Y

Valine

Val

V

 

TABLE DES MATIERES


TABLE DES MATIERES. 4

INTRODUCTION.. 11

ETUDE BIBLIOGRAPHIQUE.. 14

I.     Antibiotiques étudiés : Fluoroquinolones et Macrolides, Lincosamides, Streptogramines  15

A.    Structure, classification. 15

A.1      Les fluoroquinolones. 15

A.2      Les macrolides. 15

a)     Macrolides naturels. 15

b)     Macrolides de deuxième génération et kétolides. 16

A.3      Les lincosamides. 16

A.4      Les streptogramines. 17

B.     Spectres d’activité et modes d’action. 17

B.1       Les fluoroquinolones. 17

B.2       Les macrolides, lincosamides et streptogramines. 18

C.    Mécanismes de résistance aux fluoroquinolones et aux macrolides, lincosamides et streptogramines  19

C.1      Résistances liées à la cible. 19

a)     Fluoroquinolones.